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TransNGS^? ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina^?

ATAC文庫(kù)構(gòu)建試劑盒適配illumina平臺(tái)

目錄號(hào)	規(guī)格	單價(jià)
KP171-01	12 rxns	3960
KP171-02	96 rxns	28160

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產(chǎn)品詳情介紹

TransNGS^? ATAC-Seq Library Prep Kit for Illumina^?是針對(duì)Illumina高通量測(cè)序平臺(tái)開發(fā)的，適用于普通哺乳動(dòng)物細(xì)胞的ATAC文庫(kù)構(gòu)建試劑盒，所得文庫(kù)可用于單端或雙端測(cè)序。該試劑盒采用新型的轉(zhuǎn)座酶技術(shù)，針對(duì)染色質(zhì)開放區(qū)域建庫(kù)測(cè)序，僅需3個(gè)小時(shí)即可完成實(shí)驗(yàn)。所需細(xì)胞量少，10-50000細(xì)胞的起始量均可以獲得高分辨率的測(cè)序圖譜。

產(chǎn)品組成

實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)

文庫(kù)產(chǎn)量高

對(duì)3種哺乳動(dòng)物細(xì)胞以50,000、10,000 cells為起始細(xì)胞投入量進(jìn)行ATAC文庫(kù)構(gòu)建。結(jié)果表明， TransGen產(chǎn)品針對(duì)不同細(xì)胞及投入量，均可構(gòu)建高產(chǎn)量文庫(kù)。

細(xì)胞起始量低

對(duì)不同細(xì)胞投入量（50-1,000 cells）的HeLa細(xì)胞進(jìn)行ATAC文庫(kù)構(gòu)建，不同細(xì)胞投入量的擴(kuò)增循環(huán)數(shù)如上表。結(jié)果表明，TransGen產(chǎn)品可用于構(gòu)建低起始量（50個(gè)細(xì)胞）的ATAC文庫(kù)，文庫(kù)產(chǎn)量高，峰型好。

與競(jìng)品比較

分別使用TransGen和Company V產(chǎn)品對(duì)不同細(xì)胞投入量（5,000-50,000 cells）的HeLa細(xì)胞進(jìn)行ATAC文庫(kù)構(gòu)建。結(jié)果表明，TransGen產(chǎn)品的文庫(kù)產(chǎn)量、文庫(kù)峰型與競(jìng)品相比，優(yōu)于競(jìng)品。

下機(jī)數(shù)據(jù)好

對(duì)不同細(xì)胞投入量（50-50,000 cells）的HeLa細(xì)胞進(jìn)行ATAC文庫(kù)構(gòu)建，將構(gòu)建后的文庫(kù)測(cè)序，下機(jī)后進(jìn)行生信分析。結(jié)果表明，TSS富集圖顯示在基因的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)周圍富集明顯，IGV視圖顯示ATAC在關(guān)鍵位點(diǎn)與H3K4me3基因的ChIP-seq結(jié)果一致，實(shí)驗(yàn)結(jié)果真實(shí)可靠。